ቪዲዮ: የ BAM መረጃ ጠቋሚ ፋይል ምንድን ነው?
2024 ደራሲ ደራሲ: Lynn Donovan | [email protected]. ለመጨረሻ ጊዜ የተሻሻለው: 2023-12-15 23:42
ሀ BAM ፋይል (. ባም ) የሳም ሁለትዮሽ ስሪት ነው። ፋይል . አንድ ሳም ፋይል (. sam) በትር የተገደበ ጽሑፍ ነው። ፋይል የተከታታይ አሰላለፍ ውሂብ የያዘ። መረጃ ጠቋሚ ማድረግ : IGV ሁለቱንም SAM እና BAM ፋይሎች በአቀማመጥ መደርደር እና ኢንዴክስ የተደረገ ፣ እና ያንን ማውጫ ፋይሎች አንድ የተወሰነ የስም ስምምነት ይከተሉ።
በተመሳሳይ ሰዎች የ BAM ፋይልን እንዴት መክፈት እችላለሁ?
ከ ዘንድ ፋይል ምናሌ ይምረጡ ክፈት እና ይምረጡ BAM ፋይሎች ከግራ በኩል. አክል የሚለውን በቀኝ በኩል ምረጥ BAM ፋይል . ወደ BAM ሙከራ ፋይሎች ያወረድከው አቃፊ በ_index_with_graph ምረጥ። ጠቅ ያድርጉ ክፈት ፣ ካርታ ይምረጡ።
በሁለተኛ ደረጃ የ BAM ፋይልን ወደ Fastq እንዴት መለወጥ እችላለሁ? BAM ፋይልን ወደ FASTQ ቅርጸት የመቀየር እርምጃዎች ከዚህ በታች አሉ። ይሄ ሊኑክስ ላይ ይሰራል እና ሳምቶኦልስ እና BEDTOOLS ያስፈልገዋል
- SAMTOLS አውርድ።
- Command tar xzvf samtools-version.tar.bz2 በመጠቀም ያውጡ።
- samtools-version በሚል ስም ማህደር ይፈጥራል።
- ወደ ማውጫ ሲዲ samtools-ስሪት ይውሰዱ።
በተመሳሳይ፣ የ BAM ፋይልን ወደ SAM ፋይል እንዴት መለወጥ እችላለሁ?
ለ SAM ን ይለውጡ ወደ BAM , የ samtools እይታ ትዕዛዝ እንጠቀማለን. የእኛ ግብዓት ውስጥ መሆኑን መግለጽ አለብን SAM ቅርጸት (በነባሪነት ይጠብቃል BAM ) -S አማራጭን በመጠቀም። ውጤቱም እንዲሆን እንፈልጋለን ማለት አለብን BAM (በነባሪነት ያዘጋጃል BAM ) ከ -b አማራጭ ጋር.
Samtools እይታ ምን ያደርጋል?
ሳምቶልስ በ BAM ቅርጸት ውስጥ ያሉትን አሰላለፍ የሚያስተካክሉ የመገልገያዎች ስብስብ ነው። ወደ SAM (ቅደም ተከተል አሰላለፍ/ካርታ) ቅርጸት ያስመጣል እና ይልካል። ያደርጋል መደርደር፣ ማዋሃድ እና መረጃ ጠቋሚ ማድረግ እና በማንኛውም ክልል ውስጥ ያሉ ንባቦችን በፍጥነት ለማምጣት ያስችላል። ሳምቶልስ በዥረት ላይ ለመስራት የተነደፈ ነው.
የሚመከር:
የድርድር መረጃ ጠቋሚ ምንድን ነው?
ፍቺ፡ የንጥሉ መገኛ ቦታ በአደራደር ውስጥ።ማስታወሻ፡ በአብዛኛዎቹ የፕሮግራሚንግ ቋንቋዎች የመጀመሪያው ድርድር ኢንዴክስ 0 ወይም 1 እና ኢንዴክሶች በተፈጥሮ ቁጥሮች ይቀጥላሉ፡ የድርድር የላይኛው ወሰን በአጠቃላይ ቋንቋ እና በስርአት የተወሰነ ሊሆን ይችላል።
በ Oracle ውስጥ መዝለል ስካን መረጃ ጠቋሚ ምንድነው?
የመረጃ ጠቋሚ መዝለል ቅኝት በOracle 10g ውስጥ ያለ አዲስ የማስፈጸሚያ እቅድ ሲሆን የOracle መጠይቅ የተዋሃደውን ኢንዴክስ መሪ ጠርዝ በማለፍ የባለብዙ እሴት ኢንዴክስ የውስጥ ቁልፎችን ማግኘት ይችላል
በ couchbase ውስጥ መረጃ ጠቋሚ እንዴት መፍጠር እችላለሁ?
ባልተመሳሰለ ሁኔታ፣ CREATE INDEX የመረጃ ጠቋሚውን ፍቺ ለመፍጠር ተግባር ይጀምራል እና ስራው እንደጨረሰ ይመለሳል። ከዚያ BUILD INDEX ትዕዛዙን በመጠቀም መረጃ ጠቋሚውን መገንባት ይችላሉ. የጂኤስአይ ኢንዴክሶች የሁኔታ መስክ ያቀርባሉ እና በመጠባበቅ ላይ ያሉ የመረጃ ጠቋሚ ሁኔታን ምልክት ያድርጉ። በGSI መረጃ ጠቋሚ፣ የመረጃ ጠቋሚ ሁኔታ 'በመጠባበቅ ላይ' ሪፖርት ማድረጉን ይቀጥላል።
በSQL አገልጋይ ውስጥ በተሰበሰበ እና ባልተሰበሰበ መረጃ ጠቋሚ መካከል ያለው ልዩነት ምንድነው?
የተሰባሰቡ ኢንዴክሶች በጠረጴዛው ላይ በአካል ተከማችተዋል. ይህ ማለት እነሱ በጣም ፈጣኖች ናቸው እና በአንድ ሠንጠረዥ አንድ የተሰባጠረ ኢንዴክስ ብቻ ነው ሊኖርዎት የሚችለው። ያልተሰበሰቡ ኢንዴክሶች ለየብቻ ተቀምጠዋል፣ እና የፈለጉትን ያህል ሊኖሩዎት ይችላሉ። በጣም ጥሩው አማራጭ የእርስዎን የተከማቸ መረጃ ጠቋሚ በብዛት ጥቅም ላይ በሚውለው ልዩ አምድ ላይ፣ አብዛኛውን ጊዜ ፒኬ ማዘጋጀት ነው።
በ SQL አገልጋይ ውስጥ ከምሳሌ ጋር የተሰባሰበ መረጃ ጠቋሚ ምንድን ነው?
የተሰባሰበ መረጃ ጠቋሚ። የተጣመረ መረጃ ጠቋሚ በሠንጠረዥ ውስጥ በአካል የተከማቸበትን ቅደም ተከተል ይገልጻል። የሰንጠረዥ መረጃ መደርደር የሚቻለው በአንድ መንገድ ብቻ ነው፣ ስለዚህ በአንድ ሠንጠረዥ አንድ የተሰባጠረ ኢንዴክስ ብቻ ሊኖር ይችላል። በSQL አገልጋይ ውስጥ፣ ዋናው የቁልፍ ገደብ በዚያ የተወሰነ አምድ ላይ የተሰባሰበ መረጃ ጠቋሚን በራስ-ሰር ይፈጥራል